قصة فيلم Boku no Hero Academia the Movie 3: World Heroes’ Mission تدور أحداثها حول منظمة غامضة مخصصة لتدمير أشخاص مختلفين والذين يشكلون تهديدًا بزرع القنابل في جميع أنحاء العالم. الأبطال المحترفون، بالإضافة إلى الأبطال المتدربين، ينطلقون للعثور على القنابل. كل من “ديكو” و “باكوغو” و “تودوروكي” يلتقون “رودي”، وهو صبي يعيش في منزل متنقل في المنطقة المخصصة لهم في “اوسيون”، وينتهي بهم الأمر بالعمل معه. مجموعة “هوماريس” مقتنعة بأن جميع البشر الذين لديهم قدرات مصابون بالمرض ويجب القضاء عليهم. ومن أجل إعادة بناء العالم، قام المتطرفون ببناء جهاز قاتل يعرف باسم “قنبلة الزناد“، مما يجعل الناس الذين لديهم قدرات يفقدون السيطرة ويموتون. قائدهم، “فليكت ترن“، يتهرب من أن يتم القبض عليه من الأبطال المحترفين المنتشرين حول العالم. أثناء دراسته في بلدة “أوثيون” مع بطل اليابان الأول، تم اتهام “ميدوريا إيزوكو” بجريمة لم يرتكبها. عن غير قصد “ميدوريا” تورط مع “رودي سول“، فتى محلي، وسرعان ما يجد نفسه هاربا مع الصبي. والآن يعود الأمر إلى “رودي“، و”ميدوريا“، وزملائه لوقف مؤامرة “قنبلة الزناد” التي يشنها “فليكت“، كل هذا بينما يحاولون النجاة من الأعضاء الآخرين من “هوماريس“.